Yksi Biosfääriakatemia-hankkeen tehtävistä on perustaa nuorisoneuvosto. Neuvosto koostuu nuorista, joilla on yhteys Saaristomeren Biosfääri-alueeseen. Suunnitelmana on myös vakiinnuttaa yhteistyötä muiden kansainvälisten biosfäärialueiden nuorisoneuvostojen kanssa.